این پژوهش به منظور بررسی چند شکلی ژن GOLA-DRB3 با استفاده از PCR-RFLP در بز ندوشن صورت گرفت. در این طرح، از 100 بز به صورت تصادفی خونگیری شد. سپس DNA نمونه های خون دام ها با استفاده از کیت DIAtom DNA pr استخراج گردید. برای تعیین کمیت و کیفیت آن از ژل آگارز یک درصد و اسپکتروفتومتر استفاده شد. ناحیه اگزون 2 جایگاه GOLA-DRB3 به طول bp285 با روش Heminested-PCR در دو مرحله تکثیر و محصولات PCR توسط آنزیم Taq برش داده شدند. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز با ژل اکریل آمید 10% یا 2% و رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید آشکار گردید. نتایج هضم محصولات PCR با آنزیم TaqI شامل دو قطعه 163bp و122bp (الگوی هضمی T) یا قطعه هضم نشده285bp (الگوی هضمی t) بود. جمعیت از لحاظ ژن GOLA-DRB3 انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ را نشان نداد (p>0.05). شاخص شانون، شاخص نیی، هتروزایگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار به ترتیب 0.68، 0.49، 0.55 و 0.49 محاسبه گردید. با توجه به نتایج حاصله کارایی نشانگر GOLA-DBR3 جهت تعیین تنوع ژنتیکی خوب است. با استفاده از نتایج این پژوهش و پژوهش های قبلی و با در دست داشتن رکوردها واطلاعات کمی جایگاه در این جمعیت، می توان شناسایی و تعیین محل جایگاه های موثر بر صفات کمی را انجام داد.

بز سرخ جبال بارز با جمعیتی بالغ بر 450 هزار رأس در منطقه جیرفت و کهنوج پرورش می یابد و با تولید کرک، گوشت قرمز و محصولات لبنی از منابع درآمد مهم عشایر و دامداران محسوب می شود. در این پژوهش که به منظور بررسی چند شکلی ژن GOLA-DRB3 با استفاده از PCR-REFLP در این دام ها صورت گرفت از 100 بز به صورت تصادفی و انفرادی خونگیری شد. سپس DNA نمونه های خون دام ها با استفاده از کیت استاندارد استخراج و تعیین کمیت و کیفیت شد. ناحیه اگزون 2 جایگاه GOLA-DRB3 به طول 285bp با روش Heminested-PCR در دو مرحله تکثیر و محصول PCR توسط آنزیم TaqI برش داده شد. محصولات هضم شده توسط الکتروفورز با ژل اکریل آمید 10% یا ژل 2% و رنگ آمیزی اتیدیوم بروماید آشکار شد. نتایج هضم محصولات PCR با آنزیم TaqI شامل دو قطعه 163bp و 122bp (الگوی هضمی T) یا قطعه هضم نشده285bp  (الگوی هضمی T) بود. جمعیت از لحاظ ژن GOLA-DRB3 انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ نشان نداد (P<0.05). شاخص شانون، شاخص نیی، هتروزایگوسیتی مشاهده شده و هتروزایگوسیتی مورد انتظار به ترتیب 0.69، 0.50، 0.52 و 0.50 محاسبه شد. نتایج نشان داد که جمعیت مورد مطالعه تنوع ژنتیکی خوبی دارد و کارایی نشانگر GOLA-DRB3 جهت تعیین تنوع ژنتیکی خوب است. با استفاده از نتایج این پژوهش و پژوهش های قبلی و با در دست داشتن رکوردها و اطلاعات کمی جایگاه در این جمعیت، می توان شناسایی و تعیین محل جایگاه های موثر بر صفات کمی را انجام داد.

مجتمع اصلی سازگاری نسجی (MHC) شامل گروهی از ژن ها است که نقش مهمی را در پاسخ های ایمنی داشته و به سه دسته MHC کلاس 1 و 2 و 3 تقسیم می شوند. در گاو MHC یا سیستم آنتی ژن لنفوسیتی به نام BoLA شناخته می شود و روی کروموزوم 23 قرار دارد. ژن های اگزون 2 از ژن (BoLA-DRB3 2.) BoLA-DRB3 بخشی از MHC کلاس 2 در گاو است که تنوع بسیار بالایی داشته و آلل های آن با مقاومت و حساسیت به بیماری ها و همچنین با خصوصیات باروری، رشد و تولید شیر در گاو مرتبط هستند. در این مطالعه چند شکلی 2.BoLA-DRB3 به وسیله روش PCR-RFLP روی 350 نمونه خون گاو هلشتاین ایران مورد بررسی قرار گرفت. پس از استخراج DNA از نمونه های خون کامل2 .BoLA-DRB3 به وسیله روش Seminested PCR افزوده سازی شد و محصولات PCR به وسیله آنزیم های محدود الاثر RsaI, PsuI و HaeIII برش داده شدند. در مجموع 18 الگوی متفاوت در برش های آنزیمی مشاهده شد. با تحلیل الگوهای برش آنزیمی، 48 آلل متفاوت و در این بین 9 آلل جدید در جمعیت مورد مطالعه شناسایی شدند. در تحلیل جمعیتی، فراوانی آلل ها و ژنوتیپ ها، میزان هوموزیگوتی و هتروزیگوتی مورد انتظار و مشاهده شده سنجیده شد. نتایج این مطالعه نشان دهنده چند شکلی بالای 2.BoLA-DRB3 است. همچنین در مقایسه، فراوانی آلل های مستعد کننده به بیماری لکوز بیش از تب برفکی، ورم پستان و برخی بیماری های انگلی بود. شایان ذکر است که فراوانی آلل های مفید در صفات تولید شیر نیز مشابه با سایر جمعیت های بررسی شده بود.

از ژن های سیستم ایمنی که آلل های مختلف آن نقش مهمی در ایجاد حساسیت و یا مقاومت به بیماری ورم پستان دارد، ژن BoLA-DRB3 میباشد. در مرحله اول این پژوهش تعداد 30 نمونه خون از 30 راس گاو نژاد سرابی (از منطقه سراب و مناطق اطراف آن)، 39 نمونه خون دیگر از 39 راس گاو نژاد هلشتاین (از گاوداری های اطراف تهران) و 214 نمونه خون از گاوهای هلشتاین کشت و صنعت مغان که 150 راس از این گاوها حساس و 64 راس آنها مقاوم به بیماری ورم پستان بودند (در قالب 41 خانواده ناتنی) تهیه گردید. جهت بررسی چندشکلی در ریزماهواره های موجود در اینترون 2 ژن BoLA-DRB و محاسبه فراوانی اللی نشانگرها و همچنین مقایسه تنوع اللی در بین نژاد بومی ایران (سرابی) و نژاد اصلاح شده (نژاد هلشتاین)، نمونه های خون بطور تصادفی تهیه گردید. در این نمونه ها، دو ریزماهواره ای DRB3 و DRBP1 (هر دو در داخل اینترون 2 ژن DRB قرار دارند) مورد بررسی قرار گرفتند. در مرحله دوم، جهت بررسی پیوستگی احتمالی بیماری ورم پستان با آلل های مختلف ژن مورد نظر، ریزماهواره DRB3 در 214 راس گاو شیرده مورد استفاده قرار گرفت. در نژاد سرابی 9 و 5 الل و در نژاد هلشتاین 10 و 4 الل مختلف به ترتیب برای نشانگرهای DRBP1 و DRB3 مشاهده گردید و ضریب هتروزیگوسیتی برای دو نشانگر در نژاد سرابی و هلشتاین به ترتیب 0.49 و 0.67 محاسبه گردید. نتایج این مطالعه نشان می دهند که نشانگرهای DRB3 و DRBP1 در نژاد بومی ایران (سرابی) چندشکلی دارند و می توانند به عنوان نشانگر ژنتیکی مورد استفاده قرار گیرند. در 214 نمونه بررسی شده از گاوهای شیرده هلشتاین نیز تعداد 8 نوع الل برای نشانگر DRB3 مشاهده گردید. با توجه به نتایج بدست آمده از تجزیه آماری داده ها، الل شماره 5 پیوستگی معنی داری (P<0.05) با بیماری ورم پستان نشان داد.

کروموزوم فیلادلفیا در 95 درصد بیماران مبتلا به CML یافت می شود. این ترانسلوکاسیون در نتیجه انتقال دو طرفه ژن r از کروموزوم 22 و abl از کروموزوم 9 است. ژن حاصل از ترانسلوکاسیون یعنی bcr/abl در بررسی با PCR، عمدتا به دو در بیماران مبتلا به CML قابل مشاهده است. bcr/abl با اندازه های نوکلئوتیدی 234 bp و 304 bp این قطعه می توان با استفاده از PCR تکثیر و تشخیص داد. با این روش تشخیصی می توان یک سلول مبتلا را در میان یک میلیون سلول ردیابی کرد. اهمیت این روش کارایی آن در یافتن Minimal Residual Disease پس از پیوند مغز استخوان است. تشخیص RD در فاصله 12-6 ماه پس از پیوند یک فاکتور باارزش و مستقل برای پیش بینی احتمال عود در آینده است. در این مطالعه از تکثیر Multiplex nested RT-PCR برای شناسایی انواع ترانسلوکاسیونهای فیلادلفیا بر روی بیماران مبتلا به CML و بیماری که آلوژنیک مغز استخوان را دریافت کرده بود، استفاده شد. در این بیمار باند مربوط به bcr/abl ردیابی نشد و فقط بیان مربوط به مایکروگلبولین مشاهده گردید و به این وسیله MRD رد شد. همچنین تکنیک RD-PCR رقابتی جهت اندازه گیری بیان ژن bcr/abl راه اندازی گردید.

زمینه مطالعه: مجتمع اصلی سازگاری نسجی (MHC) شامل گروهی از ژن ها است که نقش مهمی در پاسخ های ایمنی دارند. اگزون 2 از ژن BuLA-DRB3 بخشی از MHC کلاس 2 در گاومیش است که تنوع بسیار بالایی داشته و آلل های آن با مقاومت/حساسیت به بیماریها و همچنین با خصوصیات تولیدی مرتبط هستند.هدف: شناسایی تنوع ژن BuLA-DRB3 در گاومیش های خوزستان و مقایسه آن با سایر جمعیت های گاومیش ایران و جهان.روش کار: نمونه های خون از 136 گاومیش رودخانه ای خوزستانی غیر خویشاوند تهیه گردید. پس از استخراج DNA، اگزون دو از ژن BuLA-DRB3 با روش seminested PCR افزوده سازی شد. سپس قطعات حاصل از افزوده سازی اگزون دو به وسیله آنزیم محدوداثر RsaI برش داده شدند. در ادامه، فراوانی آللی، فراوانی ژنوتیپی، هوموزیگوتی و هتروزیگوتی مورد انتظار و مشاهده شده محاسبه گردید.نتایج: در آنالیز قطعات برشی به ترتیب 13 و 24 الگوی آللی و ژنوتیپی برای آنزیم برشی RsaI شناسایی گردید. 10 مورد از این آلل ها پیش از این گزارش شده بودند. فراوانترین ژنوتیپ (0.1691) oo بوده که به دنبال آن ژنوتیپ های (0.1544) hh، (0.1103) ll، (0.0955) lw، (0.0808) lh، (0.0661) ha و (0.0514) lo قرار داشتند. همچنین چهار آلل با فراوانی بالا به ترتیب آلل های (0.2721) o، (0.2316) h، (0.2316) l و (0.1176) w بودند. این هفت ژنوتیپ و چهار آلل به ترتیب %72.76 و %74.29 فراوانی ژنوتیپی و آللی جمعیت را در بر می گیرند. به علاوه، تخمین هتروزیگوتی/هوموزیگوتی و انحراف از تعادل جمعیت مربوطه حاکی از این مورد است که هوموزیگوتی مشاهده شده بیش از هتروزیگوتی مشاهده شده است و جمعیت از تعادل هاردی واینبرگ انحراف دارد.بحث: نتایج مطالعه حاضر حاکی از تنوع بالای اگزون دو از ژن BuLA-DRB3 در میان جمعیت گاومیش های خوزستان بوده و در عین تفاوت ها در تنوع ژنتیکی MHC گاومیش ها در نقاط مختلف دنیا، جمعیت گاومیش خوزستان با جمعیت گاومیش مصر مشابهت بیشتری دارد.

زمینه و هدف: سویه های باکتری هلیکوباکترپیلوری که دارای پروتئین Cag A (Cytotoxin associated GENE A) می باشند؛ استعداد بیشتری برای ایجاد بیماری دارند. این پروتئین بیماری زایی باکتری را با افزایش تولید سیتوتوکسین در سلول میزبان تسریع می نماید. این مطالعه به منظور تعیین فراوانی آنتی بادی ضد CagA در افراد آلوده به هلیکوباکترپیلوری در استان گلستان انجام شد.روش بررسی: این مطالعه توصیفی روی 676 نفر از افراد آلوده به هلیکوباکترپیلوری در استان گلستان طی سال 1387 انجام گردید. در این افراد وجود آنتی بادی ضد CagA از کلاس IgG به روش الیزا تعیین شد. داده ها با استفاده از آزمون آماری کای اسکوئر در نرم افزار آماری SPSS-16 تجزیه و تحلیل شدند. سطح معنی داری کمتر از 0.05 در نظر گرفته شد.یافته ها: فراوانی آنتی بادی ضد Cag A در افراد آلوده به هیلکوباکترپیلوری  57.7درصد(95% CI:539-61.4) برآورد گردید. این فراوانی در مردان  56.3درصد و در زنان  58.9درصد بود. گروه سنی 15 -24 سال و کودکان زیر 5 سال با شیوع 63.4 درصد و  26.3درصد بالاترین و کمترین فراوانی را داشتند. گروه قومی سیستانی با شیوع  67.2درصد نسبت به گروه های قومی ترکمن ( 57.5درصد) و فارس ( 53.6درصد) بیشترین موارد آنتی بادی را نشان دادند. توزیع این سویه ها در ساکنین روستا ( 58.1درصد) بیش از شهر ( 57.1درصد) بود. توزیع فراوانی موارد مثبت CagA در شهر مینودشت در شرق استان (78 درصد) بالاتر و بندرگز در غرب (44 درصد) پایین تر از بقیه بود.نتیجه گیری: این مطالعه نشان داد که فراوانی سویه های CagA مثبت افراد آلوده با هلیکوباکترپیلوری در استان گلستان مشابه بسیاری از مناطق دیگر ایران، آسیا و اروپا است؛ ولی از مناطق آفریقایی بالاتر است.